Carpignano Salentino sorge a 70 m slm nel Salento meridionale, dista solo 10 km dalla costa adriatica, e 15 da Otranto. Il suo territorio comprende anche la frazione di Serrano distante 1 km.
Anche se mancano prove certe pare abbastanza sicura l' origine messapica di Carpignano che avrebbe anche determinato il nome: nella lingua dei Messapi "karp" corrisponde alla parola "roccia" per cui Carpignano significherebbe "luogo posto su un altura".
In epoca romana si avvalse della sua vicinanza all'asse viario della via Traiana-Costantiniana per svilupparsi.
Non meno importanza ebbero per la sua storia i monaci bizantini basiliani che intorno al IX, X secolo si rifugiarono in queste terre ove un tempo si parlava greco. Infatti Carpignano fa parte del Consorzio "la Grecia Salentina" anche se la sua popolazione , ai nostri giorni, contrariamente agli altri paesi del consorzio, non parla il griko , un dialetto ellonofono che si è tramandato per più di un millennio.
Testimonianza di quell'epoca è la Cripta Bizantina di S. Cristina, databile al X sec. d.C. in cui è possibile ammirare antichissimi affreschi.
Poco distante dal santuario sorge un "menhir" risalente all' età rupestre. Di interesse anche il Palazzo Ducale e la Chiesa Madre dal campanile della quale si può ammirare una splendida vista.